可以针对加班超过36小时的情况申请劳动仲裁。依据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，劳动者在加班时应当得到相应的加班费，包括在工作时间、休息日及法定节假日的加班。如雇主未支付加班费，劳动者有权申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
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针对加班超过36小时的争议，处理方式包括协商、调解和仲裁。您可以根据实际情况选择合适的处理方式。轻微争议可尝试与雇主协商，快速解决；复杂争议可考虑申请调解，寻求第三方意见协助解决；若协商和调解无法达成一致，可进一步申请劳动仲裁。
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针对加班超过36小时的争议，如需要申请劳动仲裁，操作步骤如下：首先，收集加班证据，如工时记录、同事证言等；其次，向当地劳动仲裁机构提交仲裁申请并附上相关证据；然后，等待仲裁机构受理并安排庭审；在庭审过程中，陈述事实并举证；最后，根据仲裁结果采取行动，如不满意可向人民法院起诉。